En vacances dans la forêt tropicale d'Awazon, Wario se repose. Mais alors qu'il fait une sieste, il est réveillé par des castors. Examinant la jungle environnante, il remarque d'étranges créatures masquées entrant dans une caverne secrète, dissimulée par une chute d'eau. Décidant de les suivre, Wario tombe alors dans une salle ou est amassé un trésor fabuleux. Après avoir maîtrisé les gardes, il essaye de voler le trésor, mais juste avant qu'il sorte de la salle, le plancher s'effondre et il tombe tout au fond de la caverne. Et le jeu commenceÂ…